www.黄片视频在线播放,欧美精品日韩精品一级黄,成年男女免费视频网站,99久久久国产精品免费牛牛四川,99久久精品国产9999高清,乱人妻中文字幕视频4399,亚洲男人在线视频观看

基于ITS2序列鑒別牡丹皮藥材及其混偽品

發(fā)布時(shí)間:2019-08-28 來(lái)源: 短文摘抄 點(diǎn)擊:

http://img1.qikan.com.cn/qkimages/zgyi/zgyi201412/zgyi20141207-1-l.jpghttp://img1.qikan.com.cn/qkimages/zgyi/zgyi201412/zgyi20141207-2-l.jpghttp://img1.qikan.com.cn/qkimages/zgyi/zgyi201412/zgyi20141207-3-l.jpg
  [摘要]該研究應(yīng)用ITS2序列鑒別牡丹皮藥材及其混偽品,以期探索牡丹皮藥材準(zhǔn)確鑒別的新方法。提取牡丹皮及其混偽品的DNA,目標(biāo)片段經(jīng)PCR擴(kuò)增后測(cè)序,通過(guò)CodonCode Aligner V3.7.1對(duì)測(cè)序序列進(jìn)行質(zhì)量分析和拼接,基于MEGA 5.0中的K2P模型計(jì)算牡丹皮與其混偽品的種內(nèi)、種間遺傳距離及構(gòu)建系統(tǒng)聚類樹(shù)。牡丹皮ITS2序列長(zhǎng)度為227 bp,種內(nèi)最大K2P距離為0,它與各混偽品的種間最小K2P距離為0.041,種間平均K2P距離為0.222。由NJ樹(shù)可知:不同產(chǎn)地來(lái)源的牡丹皮藥材個(gè)體聚為一支,自展支持率為99%,呈現(xiàn)出明顯的單系性,能很好地與其混偽品芍藥、川赤芍、白鮮皮、朱砂根區(qū)分開(kāi)來(lái)。應(yīng)用ITS2序列可以準(zhǔn)確鑒別牡丹皮藥材及其混偽品,該方法可以作為傳統(tǒng)鑒別方法的有效補(bǔ)充。
  [關(guān)鍵詞]牡丹皮;混偽品;ITS2;鑒別
  牡丹皮為毛茛科芍藥屬植物牡丹Paeonia suffruticosa Andr.的干燥根皮[1],但在我國(guó)有些地區(qū),卻將其同屬植物芍藥P. lactiflora Pall.和川赤芍P. veitchii Lynch、蕓香科植物白鮮Dictamnus dasycarpus Turcz.以及紫金?浦参镏焐案鵄rdisia crenata Sims的干燥根皮作牡丹皮使用[2-9],F(xiàn)代藥理研究表明,牡丹皮具有抗菌、抗病毒、抗炎、解熱、鎮(zhèn)痛、鎮(zhèn)靜、抗動(dòng)脈粥樣硬化、抗心律失常等多種藥理作用[10-12]。但它的混偽品僅含少量甚至不含其主要活性成分丹皮酚(paeonol)[13-15],它們的混用必然會(huì)影響牡丹皮藥材的使用、研究和開(kāi)發(fā)。而依靠傳統(tǒng)的性狀、顯微和理化鑒別方法既要求操作人員具有較深厚的專業(yè)知識(shí),又難以將易混藥材準(zhǔn)確鑒別到種,這并不適應(yīng)中醫(yī)藥現(xiàn)代化發(fā)展的要求。
  近年來(lái),DNA條形碼(DNA barcoding)技術(shù)以其通用性強(qiáng)、易數(shù)字化等優(yōu)點(diǎn),迅速成為生物分類和鑒定的研究熱點(diǎn)。它是利用基因組中一段公認(rèn)標(biāo)準(zhǔn)的、相對(duì)較短的、有足夠變異但兩端相對(duì)保守的序列進(jìn)行物種鑒定的分子診斷新技術(shù)[16]。在中藥鑒定領(lǐng)域,中國(guó)學(xué)者已提出將ITS2 (internal transcribed spacer 2)序列作為藥用植物鑒定的通用條形碼序列[17-23]。本研究應(yīng)用ITS2序列鑒別牡丹皮及其混偽品,以期探索牡丹皮藥材準(zhǔn)確鑒別的新方法。
  1 材料與方法
  1.1 材料 本研究通過(guò)實(shí)地采集、藥材市場(chǎng)購(gòu)買等方式收集未經(jīng)炮制的牡丹皮及其混偽品樣本51份,經(jīng)中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院藥用植物研究所林余霖研究員鑒定,憑證標(biāo)本保存于中國(guó)中醫(yī)科學(xué)院中藥研究所。另從GenBank中下載7條序列(登錄號(hào)為GQ434607,GQ434600,GQ434601,GQ434602,GQ434603,GQ434841,GQ434842)。樣本信息詳見(jiàn)表1。
  1.2 模板DNA的制備 刮去牡丹皮藥材及其混偽品的外表皮,取其內(nèi)部組織約40 mg;加入10% PVP40(原植物葉片中不加),用高通量組織研磨儀(scientz-48,China)在50 Hz條件下研磨120 s;利用植物DNA提取試劑盒(Tiangen Biotech Co.,中國(guó))提取總DNA。提取過(guò)程中,向藥材粉末中加入細(xì)胞裂解液,56 ℃水浴過(guò)夜;用氯仿-異戊醇(24∶1)抽提2次;在進(jìn)行沉淀DNA操作時(shí)將沉淀劑改為-20 ℃預(yù)冷的異丙醇[24]
  1.3 PCR擴(kuò)增及測(cè)序 ITS2通用引物:正向引物S2F:5′-ATGCGATACTTGGTGTGAAT-3′,反向引物S3R:5′-GACGCTTCTCCAGACTACAAT-3′。反應(yīng)體系:2×Taq PCR Master Mix 12.5 μL,正反向引物(2.5 μmol·L-1)各1.0 μL,總DNA 2 μL,加ddH2O至25 μL。擴(kuò)增程序:94 ℃變性5 min;94 ℃變性30 s,56 ℃退火30 s,72 ℃延伸45 s(進(jìn)行40個(gè)循環(huán));72 ℃延伸10 min[25]。電泳檢查PCR擴(kuò)增情況,產(chǎn)物經(jīng)純化后進(jìn)行雙向測(cè)序。
  1.4 數(shù)據(jù)處理 對(duì)獲得的測(cè)序序列使用CodonCode Aligner V3.7.1 (Codon Code Co.,USA )進(jìn)行質(zhì)量分析和拼接,去除引物區(qū);采用注釋方法(基于隱馬爾科夫模型)去除所得序列的5.8S端和28S端以獲得ITS2間隔區(qū)序列(從GenBank中下載的7條序列均為完整的ITS2序列,不必注釋);將所有ITS2序列用MEGA(molecular evolutionary genetics analysis)5.0進(jìn)行分析比對(duì),并基于K2P模型(Kimura 2-parameter model)進(jìn)行遺傳距離分析及采用鄰接(NJ)法構(gòu)建系統(tǒng)聚類樹(shù)[26]。
  2 結(jié)果與分析
  2.1 牡丹皮的種內(nèi)序列分析 牡丹皮藥材不同產(chǎn)地樣本共20條序列,比對(duì)后長(zhǎng)度為227 bp,平均GC含量為59.0%,種內(nèi)無(wú)變異位點(diǎn),種內(nèi)最大K2P距離為0。
  2.2 牡丹皮與其混偽品的種間序列分析 芍藥17條序列,比對(duì)后長(zhǎng)度為227 bp,平均GC含量為57.1%;川赤芍7條序列,比對(duì)后長(zhǎng)度為228 bp,平均GC含量為56.7%;朱砂根7條序列,比對(duì)后長(zhǎng)度為217 bp,平均GC含量為59.1%;白鮮皮10條序列,比對(duì)后長(zhǎng)度為222 bp,平均GC含量為63.9%。牡丹皮藥材與各混偽品的ITS2序列種間最小K2P距離為0.041,種間平均K2P距離為0.222。本研究中,牡丹皮與其最常見(jiàn)混偽品芍藥的3種單倍型的ITS2序列間變異情況見(jiàn)表2。

相關(guān)熱詞搜索:偽品 牡丹皮 序列 鑒別 藥材

版權(quán)所有 蒲公英文摘 www.91mayou.com